Lihat sumber Struktur Molekul Pepsin

Struktur pepsin telah menjadi fokus utama dalam studi [[biokimia]] enzim. Pepsin merupakan protein globular dengan struktur kompleks yang memungkinkan interaksi spesifik dengan substratnya. Penelitian tentang struktur pepsin memberikan wawasan tentang mekanisme kerja enzim protease secara umum.

== Komposisi Rantai Polipeptida ==
Pepsin terdiri dari rantai polipeptida tunggal yang tersusun atas lebih dari 300 [[residu asam amino]]. Struktur tiga dimensi pepsin membentuk kantung aktif yang dapat mengikat protein substrat dengan presisi tinggi. 

== Situs Aktif dan Mekanisme Katalitik ==
Situs aktif pepsin mengandung residu [[aspartat]] yang sangat penting untuk aktivitas katalitiknya. Residue ini berperan dalam mengaktifkan molekul air untuk menyerang ikatan peptida pada substrat protein, menghasilkan reaksi [[hidrolisis]].

== Studi Struktur dengan Kristalografi ==
Struktur pepsin telah dipecahkan menggunakan [[kristalografi sinar-X]]. Informasi ini sangat berguna dalam memahami bagaimana pepsin dan protease lain bekerja, serta dalam pengembangan obat-obatan yang dapat menghambat aktivitas enzim ini pada kondisi medis tertentu.