Lihat sumber Bioinformatika dalam Analisis Data Proteomik

Perkembangan proteomik menghasilkan data yang sangat besar dan kompleks, sehingga memerlukan bantuan [[bioinformatika]] untuk mengelola, menganalisis, dan menginterpretasi data tersebut. Integrasi antara proteomik dan bioinformatika telah menjadi kunci dalam kemajuan penelitian biomedis modern.

== Pengolahan Data Spektrometri Massa ==
Salah satu aplikasi utama bioinformatika adalah dalam pengolahan data dari [[spektrometri massa]]. Beragam perangkat lunak bioinformatika digunakan untuk mengidentifikasi dan mengkuantifikasi protein dari data mentah spektrometri massa, seperti Mascot, MaxQuant, dan Proteome Discoverer.

== Basis Data Protein ==
Penggunaan [[basis data]] protein, seperti UniProt dan Protein Data Bank, sangat penting dalam penelitian proteomik. Basis data ini menyediakan informasi mengenai urutan, struktur, dan fungsi protein yang dapat digunakan sebagai referensi dalam analisis.

== Analisis Jaringan dan Interaksi Protein ==
Bioinformatika juga memungkinkan analisis [[jaringan protein]] dan interaksi antar protein (interactome). Dengan pendekatan ini, peneliti dapat memetakan jalur biologis dan menemukan protein-protein kunci yang berperan dalam proses fisiologis maupun patologis.